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不是剧情漏的多不多的问题，是容易造成喜三灭啊，一代的一些决定，如救阿什丽还是凯登，杀不杀莱克斯对后面两代影响很大，如果不继承存档的话，三代就有可能面对战力不足的情况
从1玩起 因为质量效应是3部曲 。
讲的是主角收到伊甸殖民星球的求救信号前去救援（凯登入队），受到了Geth和Husk的猛烈攻击，从存活居民的口中得知这一切都是由一个叫萨伦的突锐人——史上最强的幽灵所为。主角在无意中看到了一段混乱的记忆。（阿什莉入队）
向神堡议会说明的主角遭到了议会的无视和不信任。
在此期间，主角遇到了追查萨伦背叛神堡线索的途锐C-Sec人员盖拉斯，并得到了一条消息——一个叫塔莉奎利人手中握有对萨伦的不利线索（后两人都加入了主角的队伍，期间克罗根佣兵莱克斯入队）。
在将线索给议会看后，议会仍然表现出了不信任，但还是将主角任命为幽灵去追查萨伦。安德森将诺曼底送给了主角。
主角在各个星球查到了不少线索（在此期间莉亚娜入队），并且主角所看到的那段记忆通过各种方式变得越来越清晰。
后来主角得知萨伦在Virmire的研究基地将要开发出解决克罗根少孕的解药以控制克罗根大军，在牺牲了一名队员（阿什莉或凯登）后终于阻止了萨伦。（期间莱克斯根据主角的RP值决定死亡或存活）在Virmire上主角从某某收割者的精神幻影口中得知宇宙所有生物即将被收割的命运。
在总结了一系列线索以后主角得出了结论，萨伦即将在Ilos做一些不可告人的事，主角要求前去Ilos，但遭到了议会的反对，并禁止主角是用诺曼底。在安德森的帮助下，主角终于将诺曼底驶离了神堡前往Ilos。（如果跟队友有恋爱关系的话在去了Ilos后会有肉）
到了Ilos，主角一行遭到了萨伦的阻拦，但这并没有阻挡主角的步伐。在此期间主角得知自己之前看到的那些记忆是普洛仙人被收割者收割并改造的记忆，收割者能影响生物的思维，萨伦和Geth都是受到收割者的控制的，只要收割者击破了神堡那么一切都会遭到毁灭。
主角带着队友一路过关斩将通过Ilos上的传送机回到了神堡，发现那里已是一片狼藉。萨伦早已带着Geth登陆神堡，而某某收割者也到了。为了拯救宇宙苍生，主角奋勇的与萨伦（如果RP够的话就可以让萨伦自杀，不然就得打）和最终BOSS抗争。（你可以在此决定是否拯救议会）
最后仗打完了，主角成了英雄，人类e68a84e8a2ade79fa5e98193336可以进入议会或完全控制议会，而主角将在安德森与乌迪纳之间选择一位成为人类议员。