作者：广东在线游戏网日期：
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这个故事说起来确实非常复杂，尤其是游戏本身讲故事的顺序比较乱，一会古代一会现在。我试着以时间顺序简单地说一下大致背景，因为刺客信条有一个贯穿人类历史始终的剧情。（不可能面面俱到，刺客信条的历史梗太多太杂了。）
首先，在现实生活中，进化论是人们公认的解释人类起源的说法，即:人类是由猴子演化而来。但在刺客信条的世界观里，不是这样的。那么刺客信条世界里的人类是怎么来的呢？
原来是这样的：在人类诞生之前，在约公元前五万年，还有一群高智慧生物存在（至于这些生物是怎么来的，官方似乎没有说明）。这些生物被后世称为“先行者”，他们的文明被称为“第一文明”。
先行者是非常强大的种族。他们长得像人一样，但更高大，更有智慧。同时，他们拥有“第六感”，也就是刺客一脉的“鹰眼”。然后呢，他们发明了“人类”来为他们服务。
这也就是为什么“先行者”长得像人类了，因为人类就是他们照着自己的样子做的，简直就像上帝对不对？当然了，为了控制人类，人类没有那么强大，聪明，也没有第六感。为了保险起见，他们又制造了一系列用来专门压制人类的武器，比如金苹果，权杖等等，他们被后世成为“伊甸园圣器”。
做完了这些，先行者们睥睨众生，以为从此就会高枕无忧了。没想到人类居然开始反抗自己。人类出现了“亚当”和“夏娃”两位刺客，他们是刺客的始祖。因为他们的先辈曾经与先行者通婚，体内的先行者基因使他们无惧伊甸园圣器。他们偷走了圣器，开始带领人类反抗先行者。（同时，该隐弑兄夺走金苹果，他也成为了圣殿骑士的始祖）
由于种种原因，加上自身繁殖能力不足，先行者被人类击败，自此退出历e79fa5e98193e58685e5aeb9336史舞台。而他们制造的圣器却遗落民间，落入别有用心的人手中，引出刺客与圣殿骑士的千年斗争。
在这里，首先要说明两个原则性问题，这两个问题一直被初玩者混淆，甚至有人玩了很多也不知道的概念。
第一，”刺客“不是狭义的刺客，不是《刺客列传》里的刺客，不是”十步杀一人，千里不留行“的刺客。这些叫杀手”hitman“。刺客是一个拥有相同理念的人的组织，和圣殿骑士是并列的。就好像没人认为圣殿骑士都是骑着马的吧？
第二，刺客与圣殿骑士并无好坏之分。很多人单纯的以为自己控制的是刺客，那么刺客就是好人，自己完全是在替天行道。这你就错了，或者说你被1代2代洗脑了（事实上从3代开始育碧就在为圣殿骑士洗白了）。刺客与圣殿骑士的对立，是因为他们政治理念的不同。刺客认为人性本善，人类应该拥有绝对的自由，刺客就是要捍卫这种自由。圣殿骑士认为绝大部分人类是性恶且愚蠢的，有了自由他们就会作恶。为了人类的和平与发展，就需要一些智慧且品德高尚的人来统治人类（也就是圣殿骑士）。这样看来，两边其实都有错，不能简单的认为崇尚自由的刺客就是对的。刺客代表的是无政府主义，圣殿骑士则是集权主义，事实上我还是更支持圣殿骑士的主张的（刺客们不要来查我水表）。
《刺客信百条》根据育碧同名电子系列游戏改编，讲述了卡勒姆·林奇获得先祖阿圭拉超凡的知识和能力来对抗圣殿骑士组织的故事。
卡勒姆·林奇（迈克尔·法斯宾德饰）在死刑即将执行之前清醒过来，发现他被索菲娅（玛丽昂·歌迪亚饰）选中，要度参加一个能让人类摆脱暴力冲动的计划。虚拟现实机器Animus能让用户体验祖先的记忆，被绑在机器上之后，卡勒姆·林奇意识到他是生活在西班牙宗教法庭时期一位杀手的后裔，他们寻找的是可以控制自由意志的伊甸园苹果。索菲娅被迫于父亲艾伦（杰瑞米·艾恩斯饰）的压力，她不情愿地操纵着勒姆·林奇寻找伊专甸园苹果在现代世界的下落，威胁着他身体和心理的健康。但在杀手同行Baptiste（迈克尔·威廉姆属斯饰）暗示了卡勒姆·林奇，艾伦有可能动机不纯之后，卡勒姆·林奇开始重新考虑他的行为和动机，而人类自由意志的命运悬而未决。
Desmond（戴斯蒙）一觉醒来发现自己被一群人给抓了，他们自称是圣殿骑士，并且知道Desmond是刺客，需要通过Desmond的DNA来探索古代一些伊甸园圣器的信息。于是Desmond就只能被迫进入一台叫Animus的机器，来读取自己祖先留在DNA里的记忆。他读取到了一位刺客大师Altair（阿泰尔）。Altair作为刺客首领Mualim最得意的弟子，被派遣一项任务和两名刺客兄弟去一个古墓中拿取一件宝物，但当Altair到达的时候发现圣殿骑士已经取得了宝物。Altair高估了自己的能力硬碰硬，结果害死了自己的一个兄弟，另一个兄弟夺回了宝物死里逃生。于是回来后Altair被贬为最低等的刺客从头开始学习。同时，师傅Mualim让Altair刺杀九位圣殿骑士首领。Altair一步一步完成任务，但直到杀死最后一位圣殿骑士首领Robert（罗伯特）之后，他才知道原来自己的师傅Mualim是深深隐藏着的第十位圣殿骑士首领，为的就是利用Altair取得宝物，还能干掉自己的同伙。当Altair返回刺客基地马西亚夫城堡的时候，Mualim已经对那件宝物——伊甸园圣器金苹果有所研究，并得到了巨大的力量，但Altair作为正统的刺客，凭自己不屈的毅力杀死了背叛刺客的师傅。回到现代，圣殿骑士们已经对金苹果有所了解，Desmond面临着被处死的危机。同时，他发现在Animus中呆久了之后，学会了Altair的一项独特刺客技能——鹰眼，并通过鹰眼发现了地面、墙壁上的血迹。原来在他之前e68a84e799bee5baa6334已经有人被这样当做实验品，但不幸死亡。（那就是16号，Desmond是17号。）